El término "Torre Negra" aparece por primera vez en fuentes escritas en 1566 y hace referencia a la coloración negra anterior, que también se renovó durante las reformas. Hacia 1571, la torre se elevó dos pisos con ventanas góticas escalonadas. Por encima de los dos pisos de ventanas, el edificio estaba bordeado por una hilera exterior de almenas, que aún hoy son claramente visibles. A principios del siglo XVIII, se cerró la hilera de almenas y se añadió el tejado a cuatro aguas.
El portero y su familia vivían en el primer piso de ventanas de la puerta. Encima de ellos se construyeron celdas en el segundo piso. El guardián de la torre y su esposa se encargaban del cuidado de los presos. En una fase posterior de remodelación, hace unos 200 años, también se instalaron celdas en el tercer piso, a la altura de las almenas.
La puerta de roble de la celda en el segundo piso de la ventana atestigua el destino de Christian Schlenker, el "Schafbible" de Schwenningen. Fue encarcelado por delitos menores, deudas de alquiler y otras deudas que no pudo pagar. Se inmortalizó grabando su nombre y su profesión. También puede leerse que estuvo encarcelado 1004 días en 1847. Un jinete a caballo y la imagen de una iglesia forman parte de la talla.
También se encarceló a mujeres. En 1714, la soltera Katharina Päurin, de la Ciudad Vieja, fue encarcelada en la Puerta Negra. Fue acusada de infanticidio. El protocolo del interrogatorio se conserva en los archivos de la ciudad. Fue declarada culpable y condenada a muerte por la espada junto con su madre. De camino al lugar de ejecución a través de la puerta negra, el condenado fue tocado por la "campana del brazo del pecador" en el campanario.
Dos mujeres encarceladas, que al parecer estaban implicadas en el asesinato de un campesino, gritaron y se enfurecieron en su celda hasta tal punto que los habitantes de la ciudad se sintieron perturbados por el ruido. El magistrado ordenó al encargado del baño que les diera un buen baño para que se calmaran de nuevo.
Hace unos 100 años, cuando todo el tráfico pasaba por la puerta, el pasaje norte se creó para los peatones. El pasaje sur con escaparates no se creó hasta la década de 1960 por el químico Tiberius Neher.
El periodo de Württemberg estuvo a punto de acabar con la puerta, ya que en mayo de 1869 el Schwarzwälder Bürgerzeitung informaba en su portada: "Según los informes, la Puerta Negra... será demolida en un futuro próximo. No tiene valor monumental ni es arquitectónicamente bella". Sin embargo, esta idea se abandonó por temor a la estática de las casas vecinas.
La Puerta Negra sigue en pie hoy en día y es el punto de partida del desfile de carnaval de la fiesta más importante de Rottweil, Fasnet.